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Wir freuen uns, ein kürzlich veröffentlichtes Studium eines Kunden von Don Whitley Scientific vorzustellen, das unser Verständnis und die Messung des Mikrobioms im Darm, insbesondere in den frühen Lebensphasen, voranbringt.
„Bewertung der absoluten Abundanz im Mikrobenmikrobiom von Mutter und Kind unter Verwendung von aus dem Meer stammendem bakteriellen DNA-Spike-in und Vergleich mit herkömmlichen Quantifizierungsmethoden“ (Wang et al., 2025)
Die Mikrobiomforschung steht oft vor einer wesentlichen Herausforderung: Die meisten Sequenzierungsstudien berichten über relative Abundanz statt über absolute mikrobielle Counts, was zu verzerrten Interpretationen führen kann – insbesondere in Studien zum Mikrobiom im frühen Leben, in denen die mikrobiellen Lasten erheblich variieren.
Um dies zu adressieren, entwickelten und bewerteten Forscher unter der Leitung von Wang et al. eine neuartige Methode zum Spike-in mit mariner DNA, um die absolute mikrobielle Abundanz in Stuhlproben von Mutter-Kind-Paaren genauer zu schätzen. Durch die Integration von Spike-in-DNA von Pseudoalteromonas und Planococcus – Bakterien, die im menschlichen Darm nicht vorkommen – konnten sie die mikrobiale Last korrigieren und ihre Ergebnisse mit Standardmethoden wie Durchflusszytometrie, qPCR und quantitativer DNA-Bestimmung vergleichen.
Um genaue und lebensfähige bakterielle Counts sicherzustellen, wurden die Stuhlproben anaerob unter Verwendung einer Whitley A20 Anaerobe Arbeitsstation kultiviert. Die Arbeitsstation bot eine strenge sauerstofffreie Umgebung, die für das Wachstum von wählerischen, obligaten Anaerobiern, die im menschlichen Darm vorkommen, entscheidend ist.
Die Arbeitsstation ermöglichte:
• Konsistente Colony-Forming Unit (CFU)-Counts aus YCFA-Agar-Kulturen
• Genaue Vergleichsmöglichkeiten zwischen kultivierbarer Last und DNA-basierten Schätzungen
• Reproduzierbare anaerobe Handhabungsbedingungen über alle Proben hinweg
Diese Studie zeigt, dass Methoden zur Bestimmung der absoluten Abundanz, insbesondere solche, die von zuverlässigen anaeroben Kultivierungstechniken unterstützt werden, entscheidend für das Verständnis der mikrobiellen Dynamik in sensiblen Populationen wie Neugeborenen sind. Die Whitley Arbeitsstation spielte eine wichtige Rolle dabei, dass die Kulturbedingungen das natürliche Darmumfeld simulierten und die Integrität der Anaerobenzucht bewahrten.
Während sich die mikrobielle Mikrobiologie mit einem Fokus auf Mikrobiome in Richtung Präzision und Reproduzierbarkeit bewegt, bleibt die Ausrüstung wie die Whitley A20 grundlegend für die Validierung modernster molekularer Methoden.
Wenn Sie daran interessiert sind, den vollständigen Artikel zu lesen, klicken Sie bitte auf den folgenden Link: https://www.dwscientific.com/about-us/published-paper-registration-form
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