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Wir freuen uns, ein kürzlich veröffentlichte Studie eines Kunden von Don Whitley Scientific vorzustellen,das unser Verständnis und die Messung des Mikrobioms im Darm, insbesondere in den frühen Lebensphasen, voranbringt.
Bewertung der absoluten Häufigkeit im Mutter-Kind-Darmmikrobiom unter Verwendung von bakterieller DNA aus mariner Herkunft als Spike-In und Vergleich mit konventionellen Quantifizierungsmethoden. (Wang et al., 2025)
Die Mikrobiomforschung steht häufig vor einer großen Herausforderung: Die meisten Sequenzierungsstudien erfassen nur relative Häufigkeiten anstelle absoluter mikrobieller Mengen, was zu verzerrten Interpretationen führen kann – besonders in Studien zum frühen Leben, bei denen die mikrobielle Belastung stark schwankt.
Um dieses Problem zu lösen, entwickelten und evaluierten Wang et al. eine neuartige Spike-In-Methode mit DNA marinen Ursprungs, um die absolute mikrobielle Häufigkeit in Stuhlproben von Mutter-Kind-Paaren genauer zu bestimmen. Durch die Zugabe von Spike-In-DNA aus Pseudoalteromonas und Planococcus – Bakterien, die im menschlichen Darm nicht vorkommen – konnten sie die mikrobielle Belastung korrigieren und ihre Ergebnisse mit Standardmethoden wie Durchflusszytometrie, qPCR und Gesamt-DNA-Messung vergleichen.
Um genaue und verwertbare bakterielle Zählungen zu gewährleisten, wurden die Stuhlproben unter anaeroben Bedingungen in einer Whitley A20 anaeroben Arbeitsstation kultiviert. Diese Arbeitsstation ermöglichte eine streng sauerstofffreie Umgebung – entscheidend für das Wachstum anspruchsvoller, obligat anaerober Darmbakterien.
Die Arbeitsstation ermöglichte:
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Konsistente Zählungen koloniebildender Einheiten (KBE) auf YCFA-Agar
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Genaue Vergleiche zwischen kultivierbarer Belastung und DNA-basierten Schätzungen
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Reproduzierbare anaerobe Arbeitsbedingungen für alle Proben
Diese Studie zeigt, dass Methoden zur Bestimmung der absoluten Häufigkeit – insbesondere in Kombination mit zuverlässiger anaerober Kultivierung – unerlässlich sind, um mikrobielle Dynamiken in empfindlichen Populationen wie Neugeborenen zu verstehen. Die Whitley Arbeitsstation spielte dabei eine wichtige Rolle, indem sie Kulturbedingungen schuf, die der natürlichen Umgebung des Darms entsprechen und so die Integrität bei der Wiedergewinnung anaerober Bakterien bewahrte.
Während sich die mikrobiom fokussierte Mikrobiologie zunehmend in Richtung Präzision und Reproduzierbarkeit bewegt, bleiben Geräte, wie die Whitley A20, für die Validierung modernster molekularer Methoden von grundlegender Bedeutung.
Wenn Sie daran interessiert sind, den vollständigen Artikel zu lesen, klicken Sie bitte auf den folgenden Link: https://www.dwscientific.com/about-us/published-paper-registration-form
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