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Debajit Dey erhielt kürzlich das Don Whitley Scientific (DWS) Reisestipendium, um seine Forschungsergebnisse zum einzigartigen Mucin-Stoffwechsel von A. muciniphila auf der Konferenz „Wellcome Connecting Science: Microbiome Interactions in Health and Disease“ in Cambridge, Großbritannien, vorzustellen.
Wir haben Debajit gebeten, uns mehr über seine Arbeit zu erzählen:
„Akkermansia muciniphila ist ein anaerobes, obligat mucinabbauendes Bakterium, das einen bedeutenden Bestandteil der menschlichen Darmmikrobiota darstellt und häufig mit positiven gesundheitlichen Effekten in Verbindung gebracht wird. Um im Darm zu überleben, muss A. muciniphila komplexe Mucin-Glykoproteine abbauen, die stark sulfatisierte O-Glykane enthalten und die schützende Schleimschicht des Dickdarms bilden. Dieser Stoffwechselprozess erfordert spezialisierte Kohlenhydrat-Sulfatasen, die Sulfatgruppen entfernen. Die spezifischen Funktionen, strukturellen Anpassungen und zellulären Lokalisationen dieser Enzyme waren jedoch bislang weitgehend unklar. Ziel meines Projekts war es, die Kohlenhydrat-Sulfatasen von A. muciniphila zu charakterisieren, um ihre einzigartigen Mechanismen beim Abbau stark sulfatisierter Kolon-Muzine zu verstehen und sie mit denen anderer Darmbakterien zu vergleichen.
Ein zentraler Bestandteil meiner Arbeit waren biophysikalische und strukturelle Untersuchungen, die entscheidend für die Analyse der Enzymkinetik und die Bestimmung der dreidimensionalen Strukturen dieser Sulfatasen sind. Wir konnten die Substratspezifität von acht S1-Sulfatasen charakterisieren und entdeckten ein neuartiges Kohlenhydrat-bindendes Modul (CBM), das spezifisch an kolonales Mucin bindet. Meine Forschung hat gezeigt, dass A. muciniphila für ein robustes Wachstum spezifische glykopeptidische Formen von Mucin benötigt und bestimmte Desulfatierungsaktivitäten ausschließlich im Periplasma stattfinden.
Ich habe mich sehr gefreut, meine Forschungsergebnisse auf der Konferenz „Wellcome Connecting Science: Microbiome Interactions in Health and Disease“ (2.–4. März 2026) im Hinxton Hall Conference Centre auf dem Wellcome Genome Campus in Cambridge, Großbritannien, vorstellen zu dürfen. Meine Arbeit zur Strukturbiologie der Sulfatasen von Akkermansia stieß bei der Veranstaltung auf großes Interesse. Der Austausch mit führenden Experten im Bereich Mikrobiomforschung war äußerst bereichernd, und die neuesten Entwicklungen in der Genomik und Stoffwechselforschung waren sehr inspirierend. Darüber hinaus bot mir die Veranstaltung die Möglichkeit, mein berufliches Netzwerk zu erweitern und potenzielle Kooperationen zu erschließen.
Ich möchte mich herzlich bei meinem Betreuer, dem Forschungsteam des York Structural Biology Laboratory (YSBL) sowie dem technischen Support-Team für ihre ständige Unterstützung bedanken. Ebenso gilt mein besonderer Dank Don Whitley Scientific für die Förderung meiner Teilnahme an dieser renommierten Konferenz.“
Wir danken Debajit für diesen aufschlussreichen Einblick in seine Forschung und gratulieren ihm nochmals herzlich zum Erhalt des DWS Reisestipendiums.
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